Giải đã chính thức khép lại vào ngày 19-10-2012, tại Nhà Thi đấu Công an tỉnh Quảng Bình sau đúng một tuần lễ tranh tài giữa 5 đội nam và 5 đội nữ tham dự vòng chung kết.
Ở giải nữ, qua thi đấu vòng tròn một lượt, đội nữ Giấy Bãi Bằng đã toàn thắng cả 4 trận, trước Vĩnh Phúc và Hưng Yên (đều 3 - 0), Tân Bình TP. Hồ Chí Minh và Hà Nội T&T (đều 3 - 1) để dẫn đầu. Đội nữ Tân Bình TP. Hồ Chí Minh ngoài trận thua duy nhất trước Giấy Bãi Bằng đã có 3 chiến thắng trước Vĩnh Phúc, Hưng Yên, Hà Nội T&T đều với tỷ số 3 - 0 để xếp nhì bảng và cùng Giấy Bãi Bằng giành quyền thăng hạng ở mùa giải sau. Xếp tiếp theo là Hà Nội T&T (2 thắng, 2 thua), Hưng Yên (1, 3) và Vĩnh Phúc (0 - 4).
Trong khi đó ở giải nam, đội Vĩnh Long với đội hình khá đồng đều, gồm đa số các cầu thủ đã dần trưởng thành sau ngôi Á quân (năm 2010), Quán quân (năm 2011) và hạng Ba (2012) giải Vô địch Trẻ toàn quốc, đã xuất sắc đánh bại các đối thủ, lần lượt là Quân khu 4, Công an Quảng Bình, Bến Tre (đều 3 - 0), Công an TP. Hồ Chí Minh (3 - 1) để giành vị trí nhất bảng. Đội Công an TP. Hồ Chí Minh cũng tiếp bước Vĩnh Long để đoạt vé thăng hạng Đội mạnh quốc gia 2013 khi thắng 2, nhưng được 7 điểm (Bến Tre 3 - 1 và Quân khu 4: 3 - 0), thua 2 (Vĩnh Long 1 - 3 và Công an Quảng Bình 2 - 3). Xếp tiếp sau là Bến Tre 6 điểm, thắng 2 (Quân khu 4 và Công an Quảng Bình đều 3 - 0) và thua 2; Quân khu 4 được 3 điểm (1, 3), Công an Quảng Bình được 2 điểm (1, 3).
Và ở ngày thi đấu mang ý nghĩa thủ tục này, chỉ có sự đảo ngược kết quả ở giải nam so với vòng bảng trước đó khi ở trận tranh hạng Ba, Quân khu 4 đã thắng Bến Tre 3 - 1 và ở trận chung kết, Công an TP. Hồ Chí Minh cũng quật ngã Vĩnh Long với cùng tỷ số. Trong khi đó kết quả xếp hạng giải nữ không có bất ngờ, bởi Hà Nội T&T thắng Hưng Yên 3 - 0 giành giải Ba, Giấy Bãi Bằng tái lập kết quả vòng bảng trước Tân Bình TP. Hồ Chí Minh 3 - 0 trong trận chung kết nữ.
Như vậy kết quả chung cuộc giải hạng A toàn quốc năm 2012 như sau:
* Giải nam: nhất: Công an TP. Hồ Chí Minh (Cúp vô địch và 20 triệu đồng); nhì: Vĩnh Long (Cờ và 15 triệu đồng); ba: Quân khu 4 (Cờ và 10 triệu đồng).
* Giải nữ: nhất: Giấy Bãi Bằng (Cúp vô địch và 20 triệu đồng); nhì: Tân Bình TP. Hồ Chí Minh (Cờ và 15 triệu đồng); ba: Hà Nội T&T (Cờ và 10 triệu đồng).