Rác thải nông thôn đang là một vấn đề nan giải, ảnh hưởng không nhỏ đến môi trường sống của con người. Trong toàn huyện Thạnh Phú chỉ có bãi rác ở Thị trấn, còn các xã thì người dân tự xử lý. Mỗi ngày, các vùng nông thôn trong huyện thải ra một lượng rác sinh hoạt khá lớn, vì vậy biện pháp thu gom và xử lý rác thải sinh hoạt ở vùng nông thôn đang là một bài toán chưa có lời giải.
Vì không có một hướng dẫn hay quy định cụ thể nào về xử lý rác thải nông thôn, nên ở hầu hết các vùng nông thôn xử lý rác bằng cách rác thải của nhà nào, thì nhà ấy tự xử lý. Cách xử lý được áp dụng nhiều nhất là vứt xuống bất cứ chỗ nào có thể vứt được. Khi một khoảng đất trống được một nhà tận dụng để đổ rác thì nhà khác sẽ làm theo. Mỗi ngày tích tụ một ít cho đến khi bãi rác ngày một to ra. Đến khi bãi rác ấy bốc mùi hôi thối mới được chính quyền chú ý và xử lý bằng cách vận động nhân dân dọn để đổ đi nơi khác. Ngoài ra, rác thải nông nghiệp được nông dân xử lý bằng cách rửa trực tiếp cả bình phun thuốc xuống ao, hồ làm ảnh hưởng không nhỏ đến môi trường nước và các loài sinh vật sống trong nước. Cũng do thói quen, người nông dân thường vứt bỏ bao bì đựng thuốc bảo vệ thực vật ngay tại đầu bờ ruộng hoặc xuống sông, hồ gần đó. Thực hiện chương trình xây dựng nông thôn mới, nhiều địa phương cũng đã quy hoạch bãi đổ rác tập trung nhưng việc vận chuyển rác đến bãi rác là một vấn đề nan giải vì huyện chưa có kinh phí trang bị xe chuyên dụng, còn khó khăn trong việc hợp đồng người vận chuyển rác vì tiền công cho người vận chuyển rác còn thấp...
Vì vậy, hiện nay, vấn đề cần tập trung trước mắt là nâng cao công tác tuyên truyền giáo dục ý thức bảo vệ môi trường và xây dựng kế hoạch xử lý rác thải trong nhân dân, để cùng với chính quyền bảo vệ môi trường, ứng phó với biến đổi khí hậu, bảo vệ sức khỏe con người.