Vệ sinh an toàn thực phẩm (VSATTP) đóng vai trò quan trọng trong chiến lược bảo vệ sức khỏe con người, việc đảm bảo VSATTP không những làm giảm bệnh tật, tăng cường khả năng lao động mà còn góp phần phát triển kinh tế - xã hội.
Từ thực trạng trên, Bến Tre đã thành lập đoàn thanh, kiểm tra liên ngành cấp tỉnh, do Thanh tra Sở Y tế làm trưởng đoàn, Trung tâm Y tế dự phòng tỉnh làm phó đoàn, các thành viên gồm Phòng Nghiệp vụ y, Chi cục Quản lý thị trường, Phòng Cảnh sát điều tra tội phạm về trật tự quản lý kinh tế và chức vụ, Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, Sở Khoa học Công nghệ, Chi cục Thú y, Chi cục Bảo vệ thực vật; đồng thời thành lập 8 đoàn thanh, kiểm tra liên ngành cấp huyện, thị. Các đoàn thanh, kiểm tra liên ngành cấp tỉnh và cấp huyện, thị tiến hành thanh, kiểm tra các cơ sở sản xuất, chế biến, kinh doanh thực phẩm, dịch vụ ăn uống, bếp ăn tập thể theo kế hoạch, hằng tuần báo cáo kết quả về thanh tra Sở Y tế để tổng hợp báo cáo Ban Chỉ đạo liên ngành VSATTP của tỉnh.
Hàng năm, tại tỉnh Bến Tre trong tháng hành động vì chất lượng vệ sinh an toàn thực phẩm, có 141 đoàn kiểm tra (gồm tỉnh, huyện, xã); tổng số cơ sở thực phẩm quản lý trên địa bàn là 4.514 cơ sở. Tổng số cơ sở được thanh, kiểm tra là 3.796 cơ sở gồm cơ sở sản xuất, chế biến thực phẩm - kinh doanh tiêu dùng - dịch vụ ăn uống - bếp ăn tập thể. Trong số các cơ sở được thanh, kiểm tra có 2.312 cơ sở đạt chất lượng VSATTP (chiếm tỉ lệ 61,9%); số cơ sở vi phạm 1.484 cơ sở; xử lý như sau: Nhắc nhở 739 cơ sở; cảnh cáo 640 cơ sở; số cơ sở bị đình chỉ hoạt động 6; phạt tiền 105 cơ sở, hủy bỏ 17,5kg thịt bò viên có chứa hàn the, hủy bỏ 4kg chả chiên có chứa hàn the. Nội dung vi phạm chủ yếu là điều kiện vệ sinh cơ sở, vệ sinh dụng cụ trang thiết bị không đảm bảo; không tổ achức khám sức khỏe định kỳ cho công nhân trực tiếp sản xuất, kinh doanh thực phẩm, không có giấy chứng nhận đủ điều kiện VSATTP, không lưu mẫu đúng quy định, sử dụng phụ gia ngoài danh mục cho phép của Bộ Y tế, sản phẩm không đảm bảo chất lượng… Trong tháng hành động vì chất lượng VSATTP năm 2009 so với cùng kỳ năm 2008 không có tình trạng ngộ độc thực phẩm nào xảy ra.
Toàn tỉnh hiện có 26 cơ sở nước uống đóng chai, đóng bình hoạt động. Sau khi tiến hành thanh, kiểm tra, đoàn đã phát hiện có 7 cơ sở nước uống đóng chai, đóng bình nhiễm vi sinh gồm các cơ sở: Quốc Bảo, Bảo Long, Nguồn Sống, Meyer BPC, Pure H-O-H, Hapewa, Pure. Đoàn đã phạt 7 cơ sở với tổng số tiền 36 triệu đồng, đồng thời hủy bỏ 86 bình nước uống không đạt chuẩn vi sinh. Hiện tại có 4 cơ sở (Quốc Bảo, Bảo Long, Nguồn Sống, Meyer BPC) đã khắc phục quy trình sản xuất nước, kết quả đạt tiêu chuẩn vi sinh. Còn lại 3 cơ sở đang trong giai đoạn khắc phục quy trình sản xuất.
Tuy nhiên, công tác thanh kiểm tra VSATTP còn gặp khó khăn là nhiều loại thực phẩm có nguồn gốc khác nhau khó kiểm soát, người sản xuất kinh doanh chưa chú trọng đến chất lượng sản phẩm chỉ chạy theo lợi nhuận, chưa chú trọng đến sức khỏe của cộng đồng. Bên cạnh đó, trang thiết bị phục vụ công tác vận chuyển bảo quản và chế biến thực phẩm tại các cơ sở còn thiếu hoặc không đảm bảo vệ sinh. Cán bộ thực hiện chuyên trách về VSATTP còn thiếu biên chế, các trang thiết bị kiểm nghiệm tại các huyện thị còn thiếu, chưa đáp ứng yêu cầu công tác…